يازده سال پس از استقلال پاكستان، در حالي كه اين كشور دوره اي از بي ثباتي سياسي را پشت سر مي گذاشت ژنرال محمد ايوب خان، از فرماندهان ارتش پاكستان، در كودتايي بدون خون ريزي در 27 اكتبر 1958م، قدرت را در اين كشور به دست گرفت. و اسكندر ميرزا به عنوان اول
يازده سال پس از استقلال پاكستان، در حالي كه اين كشور دوره اي از بي ثباتي سياسي را پشت سر مي گذاشت ژنرال محمد ايوب خان، از فرماندهان ارتش پاكستان، در كودتايي بدون خون ريزي در 27 اكتبر 1958م، قدرت را در اين كشور به دست گرفت. و اسكندر ميرزا به عنوان اولين رئيس جمهور پاكستان مجبور به كناره گيري از قدرت شد. وي كه ابتدا فرماندهي ارتش و سپس وزارت دفاع را بر عهده داشت، قبل از كودتا جانشين رئيس جمهور بود. پس از كودتا، وي با در اختيار گرفتن سمت هاي رياست جمهوري و نخست وزيري، در پاكستان حكومت نظامي اعلام كرد. ايوب خان، اگر چه هفت سال بعد در انتخابات رياست جمهوري 1965م به پيروزي رسيد، اما به تدريج به سبب افزايش مشكلات اقتصادي و سياسي، با شورش هاي مردمي روبرو شد. بنابراين وي تصميم گرفت برخي از آزادي هاي اجتماعي را احياء نمايد. در همين رابطه به ايجاد هسته هايي به نام واحدهاي دموكراتيك بنياني، پرداخت. ژنرال ايوب خان پس از اين كه نتوانست براي تحقق خواسته هاي مردم مسلمان پاكستان كار مهمي انجام دهد. پس از يازده سال حكومت، در سال 1969م، قدرت را به داماد خود، ژنرال يحيي خان واگذار كرد.